西工大博士生“新發(fā)現(xiàn)” 實現(xiàn)癌癥風險基因準確識別

癌癥的發(fā)病機制復雜，涉及環(huán)境因素、生活方式以及遺傳等多方面影響。近日，西北工業(yè)大學在癌癥風險基因準確識別方面取得新突破，為未來腎透明細胞癌癥靶向治療提供新的分子依據(jù)和藥物研發(fā)方向。

腎透明細胞癌是最常見的腎細胞癌亞型。傳統(tǒng)癌癥風險基因識別方法主要基于突變頻率識別風險基因，但某些關(guān)鍵驅(qū)動基因在腎透明細胞癌患者中突變頻率較低，并且由于癌癥的遺傳基礎(chǔ)極其多樣，不同患者間的突變模式存在顯著差異，基于突變頻率的方法和無監(jiān)督方法在泛化性和準確性上受限。目前已知的腎透明細胞癌高可信風險基因數(shù)量有限，限制了這類方法的識別準確率。

為解決以上難題，西工大計算機學院科學智能交叉研究中心研究團隊提出了一種基于深度強化學習的計算方法RL-GenRisk，用于識別腎透明細胞癌的風險基因。在研究團隊所設(shè)計的獎勵機制引導下，模型能夠自動學習神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)參數(shù)，從而解決了監(jiān)督學習方法受限于有限標簽數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn)。實驗結(jié)果表明，這種計算方法能夠更準確地識別腎透明細胞癌的風險基因。RL-GenRisk識別出了一些潛在的腎透明細胞癌風險基因。據(jù)介紹，研究團隊通過生物實驗成功驗證了EGFR和PCLO兩個基因，發(fā)現(xiàn)抑制這兩個基因的表達都能夠顯著抑制腎透明細胞癌的進展，表明RL-GenRisk所識別出的風險基因具有作為ccRCC潛在治療靶點的潛力，可以為未來ccRCC癌癥靶向治療提供新的分子依據(jù)和藥物研發(fā)方向。

據(jù)悉，該團隊相關(guān)研究成果論文已經(jīng)在國際期刊《Nature Communications》發(fā)表。西北工業(yè)大學計算機學院博士研究生鹿大智、天津大學副教授鄭巖和四川大學博士生易賢顏翎為該論文共同第一作者，天津大學郝建業(yè)教授、四川大學艾建忠研究員和西北工業(yè)大學彭佳杰教授為共同通訊作者。

西安報業(yè)全媒體記者 任娜

   牛   為博士點贊

諾貝爾醫(yī)學獎得主

mg藏細節(jié)

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