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標題: 西安交大提出適用于中國人群的腫瘤突變負荷檢測技術(shù) [打印本頁]

作者: 范福利特 時間: 2024-5-10 00:03
標題: 西安交大提出適用于中國人群的腫瘤突變負荷檢測技術(shù)
腫瘤突變負荷（TMB）是評估腫瘤患者是否適用于免疫治療的關(guān)鍵生物標志物。5月6日，記者獲悉，西安交大提出的適用于中國人群的腫瘤突變負荷檢測技術(shù)，最低檢出限等同或優(yōu)于國外已獲批同類產(chǎn)品。近日，相關(guān)研究成果發(fā)表在生物信息學(xué)領(lǐng)域國際權(quán)威期刊《生物信息學(xué)簡報》上。

近年來，隨著腫瘤免疫藥物紛紛上市，臨床對于相應(yīng)基因檢測產(chǎn)品的需求日益迫切。

現(xiàn)有的突變檢測技術(shù)在實際運用中存在明顯的性能波動，導(dǎo)致一部分的患者存在較高的誤診風(fēng)險。究其原因，關(guān)鍵在于忽視了人群間基因組的差異性，不同人群在突變數(shù)量、種類、特征等多方面均有差別，基于西方人臨床隊列設(shè)計的軟件在處理中國癌癥患者數(shù)據(jù)時需要調(diào)整；另一方面，癌癥患者間也存在差異，而檢測軟件缺乏對差異的識別和自適應(yīng)匹配能力。因此，面向產(chǎn)業(yè)鏈需求，亟需實現(xiàn)樣本內(nèi)的區(qū)段數(shù)據(jù)特征與突變檢測策略的動態(tài)適配。

針對上述挑戰(zhàn)，西安交通大學(xué)計算機科學(xué)與技術(shù)學(xué)院的生物信息管理與數(shù)字健康研究團隊，與南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司合作，提出了一種基于推薦思想的數(shù)據(jù)特征與檢測策略動態(tài)適配的腫瘤突變檢測方法。據(jù)介紹，該方法基于元學(xué)習(xí)框架，根據(jù)測序數(shù)據(jù)在各個基因組區(qū)域的不同數(shù)據(jù)特征，智能化選擇最優(yōu)的突變檢測策略，有效控制檢測策略錯配導(dǎo)致的樣本間的性能波動問題。算法將目標檢測區(qū)域細分為突變候選區(qū)，對具有相似特征的區(qū)域聚類，再為每個類動態(tài)適配最優(yōu)的突變檢測策略。大量實驗證明，該技術(shù)顯著提高了實際生產(chǎn)中的檢測性能穩(wěn)定性。

該技術(shù)落地轉(zhuǎn)化應(yīng)用情況怎樣？據(jù)介紹，國家藥品監(jiān)督管理局通過創(chuàng)新醫(yī)療器械特別審查程序，批準南京世和醫(yī)療器械有限公司的“非小細胞肺癌組織TMB檢測試劑盒（可逆末端終止測序法）（國械注準：20233401452）”上市。該產(chǎn)品基于高通量測序技術(shù)，通過檢測人類基因組上與腫瘤高度相關(guān)的425個關(guān)鍵基因，從而計算腫瘤突變負荷（TMB），是國內(nèi)首個且唯一一個NGS大Panel基因檢測試劑盒?；蛲蛔儗用孀畹蜋z出限達2%，TMB檢出限低至5%腫瘤細胞含量，最低檢出限等同或優(yōu)于國外已獲批同類產(chǎn)品。

“所謂基因Panel，是指基因檢測時選定的基因或基因區(qū)域。簡單來說，較小的Panel只針對少量基因，通常只服務(wù)單一癌癥或常見腫瘤突變基因，通過PCR技術(shù)或高通量基因檢測均可實現(xiàn)；大Panel通常包含幾十、幾百甚至上千基因，覆蓋癌種類型廣泛，基因信息更為豐富?！毖芯繄F隊成員之一、西安交通大學(xué)計算機科學(xué)與技術(shù)學(xué)院王嘉寅教授介紹，在臨床實踐中，由于癌癥的復(fù)雜性和異質(zhì)性，大Panel有助于獲得更全面、更精準的檢測結(jié)果，降低患者負擔(dān)和醫(yī)療醫(yī)保成本。但是，大Panel的技術(shù)難度很高，此前一直為國外壟斷。該產(chǎn)品由我國自主研發(fā)并擁有知識產(chǎn)權(quán)。

西安報業(yè)全媒體記者任娜

作者: 梅花凌寒獨自開 時間: 2024-5-10 08:42
厲害了

作者: 人潮里我很好 時間: 2024-5-10 08:51
可以

作者: 親愛的路人幸福 時間: 2024-5-10 08:51
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作者: 城南花已開 時間: 2024-5-10 09:00
好的

作者: 興輝歲月 時間: 2024-5-10 09:07
可以

作者: 人潮里 時間: 2024-5-10 09:18
加油

作者: xiaomao029 時間: 2024-5-10 09:58
好

作者: 秦鎮(zhèn)老街米皮 時間: 2024-5-10 10:19
贊

作者: 鄠邑棋圣 時間: 2024-5-10 10:22
贊

作者: 好大哥 時間: 2024-5-10 12:26
厲害了

作者: 辣椒紅紅 時間: 2024-5-10 12:39
新技術(shù)

作者: 哲理理化 時間: 2024-5-10 12:51
好的

作者: 楊土豆～ 時間: 2024-5-10 12:55
技術(shù)突破

作者: 雷家老二 時間: 2024-5-10 13:07
好的

作者: zhangm 時間: 2024-5-10 13:31
好

作者: zcd 時間: 2024-5-10 17:20
仙交厲害！

作者: 紡織城織女 時間: 2024-5-10 17:44
好的

作者: 黃粱一夢呀 時間: 2024-5-10 17:47
高精尖

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